用于对 DL_POLY (Classic) 这个分子动力学(MD)软件包的数据进行处理操作的脚本和小程序是 simutil

模拟工具 该存储库代表一组脚本和小型实用程序，以协助计算化学模拟（使用 DL_POLY、GROMACS 或 Towhee）。 这些工具用于帮助结构化学中心 (CQE) 的分子和工程热力学 (MET) 小组在葡萄牙 (PT) 里斯本大学 (UL) 高等技术研究所 (IST) 进行的研究. 每个工具都设计为使用尽可能少的参数和参数。 理想情况下，程序无需提供任何内容即可运行，该工具会从调用它的文件夹中获取所需的内容。 ##实用程序 cfg2pdb - 将 CONFIG 文件从 DL_POLY 转换为要在 RASMOL 中使用的 PDB（蛋白质数据库）文件。 （当然，输出可以在其他地方使用。） cutz - 从 DL_POLY 中剪切一个 CONFIG 文件。 去除给定 z 值以下的所有水分子。 用于在研究表面张力时缩短层厚度。 dl_energy - 以表格格式检索 STATIS 文件