资源介绍
请引用为:Lavezzo,E.,Franchin,E.,Ciavarella,C.等。 压制意大利沃市的SARS-CoV-2疫情。 自然(2020)。
储存库结构
该存储库包含
在2020年2月和2020年3月进行的两次后续调查中,Vo收集的数据评估了COVID-19的流行;
用于将类似SEIR的隔间模型拟合到观察到的流行率数据的代码;
用于从传输链的重建中估计序列间隔和再现次数的代码;
该代码用于通过逻辑回归评估COVID-19感染与年龄或性别之间的关联。
数据
数据文件夹包含文件anonymised_data_public_final.xlsx ,该文件具有四页:
匿名数据(第1页)包含一个行列表,其中包含联系数据,拭子测试的日期和结果,症状和住院数据;
图例(第2页)包含对第1页中包含的信息的描述;
RT_PCR_comparison(第3页)包含病毒载量数据(Ct值和
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