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imolecule:一款可嵌入WebGL的分子查看器和文件格式转换器,用于MATLAB代码缩减
资源介绍
matlab缩小代码分子
可嵌入的webGL分子查看器和文件格式转换器。
例子
IPython的
IPython
Notebook是一个开源工具,准备在许多应用程序中替代MATLAB。
作为各种各样的科学家,我全力以赴。
因此,我制作了手柄以在笔记本电脑上使用分子。
通过pip安装:
pip
install
imolecule
打开一个新笔记本并通过键入以下内容测试设置:
import
imolecule
imolecule
.
draw
(
"CC1(C(N2C(S1)C(C2=O)NC(=O)CC3=CC=CC=C3)C(=O)O)C"
)
进入笔记本电池。
这应将指定的SMILES结构(在这种情况下为青霉素)转换,优化并绘制到笔记本中。
请注意,这需要Open
Babel才能起作用。
如果您没有Open
Babel,请参阅下面的安装详细信息。
抽屉可以处理任何指定的格式,并且可以设置为更好地处理不同的用例。
查看与IPython接口关联的文档字符串以获取更多信息。
服务器
如果要在自己的计算机上运行文件格式转换器,请使用以下命令安装该库:
pip
install
imolecul