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回顾性MS数据库:填写 lesion-volumetry 和位置
资源介绍
病变体积和位置
计算对象的病变体积和位置。
为了更好地了解管道及其使用/产生的文件,请向管道模式les_voloc_pipeline.png报告
前提条件
第一个参数必须是主题ID。
recon-all.sh必须已经启动。
文件必须以BIDS格式组织。
如果未指定任何选项,则假定为“ -all”选项。
执行此脚本之前,请运行“ source source setup_env.sh”。
用法:
les_voloc $SUBJECT_ID [-all|-p|-s|-a|-h]
选项:
-all执行所有管道。
-p步骤1-2:处理数据(MPRAGE和FLAIR),以准备进行samseg病变定位。
-s步骤3:运行samseg。
-les步骤4:制作二值化病变蒙版。
-a步骤5-10:运行分析并生成输出db文件。
-h打印此帮助。
输入:
anat / sub-$
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