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命令行和Python接口可用于访问uniprot数据库,简称为uniprot
资源介绍
uniprot_tools
uniprot 提供了一个命令行和 python 接口来访问 uniprot 数据库
可用服务:地图、检索
映射从一个格式ID的列表映射到另一个使用uniprots映射API
Args:
query: id or list of ids to be mapped
f: from ACC | P_ENTREZGENEID | ...
t: to ...
format: tab by default
Help:
for a list of all possible mappings visit
'http://www.uniprot.org/faq/28'
使用批量检索通过 uniprot acc检索请求条目
Args:
query: list of ids to retrieve
format