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DeepNano-Blitz:一款速度极快的ONT基础调用工具
资源介绍
超快速ONT呼叫者
这是一个非常快的基本选择器,它可以像普通笔记本电脑上的MinION一样快速地进行基本调用读取。
如果您觉得这项工作有用,请引用(即将发布有关他的更新的预印本):
局限性
仅在64位linux上进行了测试(外部各方使其可在MacOS上运行,请参见下文)。
现在只有R9.4.1。
建议在AMD CPU上使用: export MKL_DEBUG_CPU_TYPE=5
您需要python3(经过python 3.9测试)。 PyO3包至少需要python3.5。
在某些情况下,您可能需要export OMP_NUM_THREADS=1
安装方式
安装Rust(编程语言,而不是游戏语言,此外您应该已经拥有;))。 您可以在此处查看说明: : curl --proto '=https' --tlsv1.2 -sSf https://sh.rustup.rs |
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