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一种用于执行并行近似贝叶斯计算算法的模块化、高效且可移植的工具——pakman
资源介绍
帕克曼
一种用于运行并行近似贝叶斯计算算法的模块化,高效且可移植的工具。
介绍
Pakman是用于并行近似贝叶斯计算(ABC)算法的软件工具。 它的模块化框架基于用户可执行文件,这意味着特定问题的任务(例如模型仿真)由用户提供给Pakman的黑匣子可执行文件执行。
Pakman使用MPI(一种用于分布式计算的便携式标准)来并行执行仿真,并且设计为轻量级的,以便将最少的开销用于并行化。
Pakman将从中受益最多的问题是那些模型仿真花费相对较长的时间(大约几秒钟或更长时间)的问题。
要求
C ++ 11编译器
MPI-3.1库
> =版本3.10.2
(可选) > =版本3.6.7,具有 , 和
Pakman已通过和进行了测试。 Python不是构建Pakman所必需的,但在某些Pakman示例和创建图形中使用了Python。
建造
要构建Pakman,请运行:
$ mkdi
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