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Matlab Vesicle Tracking中的Matlab图片叠加代码:实现单囊泡跟踪的Matlab方案
资源介绍
matlab图片叠加的代码Matlab囊泡跟踪
Matlab的Matlab单囊泡跟踪
单血管跟踪算法基于单粒子跟踪算法,该算法用于获取单个帧t中单个囊泡的位置r(t),以及通过链接标识为属于的位置构建的囊泡的轨迹随着时间的流逝,相同的囊泡[1]。
进行多种调整可提高跟踪精度。
我们修改了以前的协议,并按照以下程序进行了单囊泡跟踪:
减少原始图像的噪点。
由于活细胞和未结合的荧光蛋白的自发荧光,荧光蛋白标记的细胞的背景非常嘈杂。
相机/光电倍增管(PMT)的增益也会产生整个图像背景。
但是,整个细胞自发荧光的大小比囊泡的大小大得多,并且通过高照相机/
PMT增益获得的暗电流的大小比囊泡小得多。
因此,我们对原始图像应用了带通滤波器,并从每个图像中减去了恒定的强度阈值。
我们注意到单个囊泡非常Swift地光漂白。
结果,我们计算了每个视频的平均强度漂白曲线,并将该曲线拟合为指数函数。
然后,我们根据平均强度漂白函数调整强度阈值。
[thd1all,thd2all]
=
thdFP(fname,init,final)
为感兴趣区域(不包括纤毛)设置分割蒙版。
经过步骤1)的消噪后,我们发现仍