Rust语言中finch-rs库的基因组minhashing实现

雀科 Finch是针对基因组数据的最低限度独立置换排列局部敏感哈希（“ MinHashing”）的实现。 该存储库提供了一个库和命令行界面，可在中重新实现One Codex（并添加新功能/扩展！）。 入门 安装 您可以从源代码构建Finch，这需要Rust> = 1.43 。 Rust的Cargo包裹管理器（请参阅以获得Cargo的安装说明）可以自动使用cargo install finch_cli来构建和安装Finch。 如果需要python绑定，则必须采取额外的步骤（请参阅 ）。 或者，。 用法示例 首先，我们首先为几个FASTA或FASTQ文件计算草图。 这些草图是基础基因组数据的紧凑，采样表示形式，它们使finch能够快速估计数据集之间的距离。 草绘文件使用finch sketch命令： finch sketch example.fastq example2.fastq 然后