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在matlab中集成c代码以实现scones功能:选取期望的解释性SNP

  • 更新:2024-10-03 21:46:20
  • 大小:349KB
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  • 类别:Matlab - 大数据
  • 格式:ZIP

资源介绍

Matlab集成的c代码司康饼 (S之选精读nectedËxplanatory小号NPS) 概括 实现以下方法的MATLAB代码: C.-A. Azencott,D.Grimm,M.Sugiyama,Y.Kawahara和K.Borgwardt(2013)带有图割的高效网络引导多位点关联映射,生物信息学29(13),i171-i179 相关工作和资料库 EasyGWAS :SConES已集成到GWAS数据的分析和元分析框架。 特别是,它提供了Python接口。 sfan :关于特征选择部分(即在处理了GWAS数据并为SNP评分之后),使用了不同的(更快的)maxflow解算器,该模型用Python编写,并且还包含了建议的多任务版本 杉山M. Azencott,D.Grimm,Y.Kawahara和K.Borgwardt(2014)通过最大流量在多个网络上进行多任务功能选择, SIAM ICDM ,199-207 MultiSConeS :有关此多任务版本的原始版本,请参见。 演示: 在code文件夹中,有一个MATLAB脚本demo.m 要运行演示,请启动MATLAB并输入: demo