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wsiprocess是一个用于机器学习任务的库,专注于组织病理学和细胞病理学领域中整个幻灯片图像(WSI)的处理
资源介绍
转换组织病理学/细胞病理学机器学习任务的助手
主流程
扫描一些WSI。
使用WSI注释工具进行一些注释。 (和 , 现在可参见了解详情。)
然后wsiprocess帮助将WSI +注释数据转换为补丁和易于使用的注释数据。
将为您提供GUI。
有关请参见 ,以及在已修补图像和从原始WSI加载之间进行。
安装
点用户
安装或 。 有关安装提示,请参见[wiki]。
安装wsiprocess
pip install wsiprocess
Anaconda用户
# Only for python 3.6 or higher
conda install -c tand826 wsiprocess
文献资料
例子
作为python模块
请参阅以检查流。
基本用法
import wsiprocess as wp
slide = wp . slide ( "xxx.tiff" )
annot