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在H&E组织学图像中,同时进行实例分割和分类的LeetCode-hover_net颜色分类
资源介绍
颜色分类leetcode
HoVer-Net:多组织组织学图像中细胞核的同时分割和分类
在单个网络内执行核实例分割和分类的多分支网络。
该网络利用核像素与其质心的水平和垂直距离来分离聚集的细胞。
专用的上采样分支用于对每个分段实例的核类型进行分类。
到医学图像分析论文。
这是
HoVer-Net
的官方
PyTorch
实现。
对于此代码的原始
TensorFlow
版本,请参阅
。
该存储库可用于训练
HoVer-Net
和处理图像图块或整个幻灯片图像。
作为此存储库的一部分,我们提供在以下数据集上训练的模型权重:
可以在下面的推理描述中找到检查点的链接。
设置环境
conda
env
create
-f
environment.yml
conda
activate
hovernet
pip
install
torch==1.6.0
torchvision==0.7.0
上面,我们安装了带有
CUDA
10.2
的
PyTorch
1.6
版。
存储库结构
以下是存储库中的主要目录:
dataloader/
:数据加载器和扩充管道
docs/
:repo
中使用的数字/GIF
met