Broad Institute蛋白质组基因组数据分析中心（PGDAC）的存储库由NIH临床蛋白质组学肿瘤分析联盟（CPTAC）建立，名为PANOPLY

PANOPLY：基于云的平台，用于自动化和可重复的蛋白质组学数据分析 版本1.0 PANOPLY是一个平台，可用于应用最新的统计和机器学习算法，将癌症样品中的多组数据转换为生物学上有意义且可解释的结果。 PANOPLY利用一种用于极端规模数据分析，共享和协作的云原生平台）托管蛋白质组学工作流程，并被设计为灵活，自动化，可复制，可扩展和安全的。 已经实现了适用于所有癌症类型的多种算法，并且在PANOPLY中可用于分析癌症蛋白质组学数据。 PANOPLY v1.0包含以下组件： 上的Terra生产工作区，具有预先配置的统一工作流程，可自动运行有关蛋白质组学（全局蛋白质组，磷酸化蛋白质组，乙酰基体，泛素组），转录组和拷贝数数据的所有分析任务； 以及一个，其中包括每个分析组件的单独方法。 交互式Jupyter笔记本（包含在Terra工作空间中），提供了有关上载数据，标识数据类型，指定参数以