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Matlab源代码实现DFT计算:QM_descriptors_calculation

  • 更新:2024-11-03 18:50:15
  • 大小:17KB
  • 推荐:★★★★★
  • 来源:网友上传分享
  • 类别:Matlab - 大数据
  • 格式:ZIP

资源介绍

DFT的matlab源代码QM_descriptors_calculation 该存储库包含一个QM描述符生成器,​​该生成器会自动计算原子/键描述符,例如部分费用,fukui指数和键指数。 要求 尽管可以在普通台式机上运行所有代码,但HPC使计算速度大大加快。 要运行代码,您将需要: 的Python 3.7 rdkit 2019 大熊猫 Grimme的GFN2-xtb 用于人群分析的NBO,有关NBO配置的信息,请参见: G16用于SCF计算。 前三个可以通过以下conda环境安装。 安装 从安装Miniconda 通过以下方式为QM_descriptor创建conda环境: conda env create -f environment.yml source activate QM_descriptors 用法 要计算QM描述符,请运行: python main.py --smiles <input.csv> 有关可选标志的列表,请运行: python main.py -h 需要在main.py中指定两个路径: XTB_PATH = '$GFN_XTB_PATH' G16_PATH