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用于分析Nanostring-WTA数据的方法,同时顾及了背景绑定等常见噪声源的处理,即CountCorrect

  • 更新:2024-11-05 09:55:26
  • 大小:6.37MB
  • 推荐:★★★★★
  • 来源:网友上传分享
  • 类别:其它 - 开发技术
  • 格式:ZIP

资源介绍

InSituCellTools(isctools) 使用概率生成模型和变异推论来分析NanostringWTA和其他基于探针的空间转录组学数据的方法。 配置环境 您需要安装miniconda并创建一个包含pymc3和theano的conda环境,准备在GPU上使用。 请按照以下步骤操作: 如果没有conda,请先安装Miniconda: cd /path/to/software wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh # use prefix /path/to/software/miniconda3 使用所需的软件包创建conda环境 conda create -n cellpymc python