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pappenheim的SA:castle在SARS-CoV-2现场医疗基地前的流水线
资源介绍
Pappenheim ONT-SARS-CoV-2（工作中）
从SARS-CoV-2到本地工作站的实时流水线。 Pipelinen er baseretpåsnakemake og bruger i videste omfang conda。 Allemellemværende输出er lang-pivoterede。
安装
安装conda（如果尚未安装）：
cd ~
wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
chmod +x Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
./Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
我们建议使用mamba（conda内部）将软件包安装到miniconda环境中。
conda install ma