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在Python中使用的JAGS分层漂移扩散模型(HDDM)代码存储库受到matlab代码的影响,这些脚本旨在提供将JAGS与HDDM相结合的便捷途径
资源介绍
matlab代码影响pyhddmjags
(存储库版本0.4.4)
存储库,例如在Python中使用JAGS的分层漂移扩散模型(HDDM)代码
作者:加州大学欧文分校认知科学系的Michael
D.
Nunez
先决条件
有关Ubuntu中接下来的这些安装步骤,请参见此存储库中的jags_wiener_ubuntu.md。
,可以使用pip:
pip
install
pyjags
可选的:
正在下载
可以使用git
clone
https://github.com/mdnunez/pyhddmjags.git克隆存储库
也可以通过上方的“下载zip”按钮下载该存储库。
入门
目前,每个脚本都可以单独运行以模拟分层漂移扩散模型(HDDM),然后从这些模型中查找和恢复参数估计值。
最简单的HDDM位于nolapse_test.py中。
请参阅其他脚本:recovery_test.py,blocked_exp_conds.py和gression_test.py。
这些脚本提供了将JAGS与pyjags,JAGS
Wiener模块,JAGS中的混合模型以及Python中的贝叶斯诊断一起使用的有
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