White_etal_2015_ConsBiol: 此存储库包含了在Cocos Island进行工作时所使用的代码和相关数据

科科斯岛（一个孤立的海洋保护区）不断变化的弹性支流群落组合 该存储库包含描述的用于分析的R脚本。 该数据由海底猎人潜水公司（Undersea Hunter Dive Company）拥有，因此无法在线获取。 请联系Easton White（ ）了解更多信息。 R脚本用于评估哥斯达黎加科科斯岛的12种不同的弹性s（鲨鱼和鱼）物种的丰度趋势。 脚本使用glmmadmb程序包使用广义的混合建模框架来评估趋势。 每个物种都需要一种量身定制的建模方法，以说明收集到的数据类型（计数与不存在数据）和计数数据的分布。 具有负二项式误差分布的GLMM用于记录计数数据的物种（锤头，白鳍，鹰射线，大理石射线，mo射线和蝠ta）。 在处理鹰、,和蝠ta时，我们还考虑了零膨胀计数数据。 对于剩下的六个物种，仅记录其存在或不存在。 具有二项式误差的GLMM用于对这些物种进行建模。 通过AIC通过mumin软件包比