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FiberApp是一款软件,它运用DFT的matlab源代码进行生物大分子、聚合物、细丝和纤维物体的跟踪与分析
资源介绍
DFT的matlab源代码光纤应用
描述
FiberApp是用于跟踪和分析生物大分子,聚合物,细丝和纤维物体的软件。
该软件对来自各种显微镜源(原子力或透射电子显微镜,光学,荧光,共聚焦等)的图像进行操作,通过基于A
*寻路算法的半自动跟踪程序获取对象的空间坐标,然后通过应用主动轮廓模型并生成统计,拓扑和图形输出(可从这些坐标得出)。
有5个核心面板,分别用于图像,蒙版和光纤跟踪参数,以及跟踪的数据信息和光纤视图属性。
一个面板用于生成带有模拟原纤维和相应XYZ数据的图像,其目的是跟踪质量和算法正确性验证。
在当前版本中,有14种数据处理工具,可以确定基本的单对象形态参数,分布,集体取向行为等。
处理工具包括:
高度轮廓
高度自相关功能(ACF)
高度离散傅立叶变换(DFT)
高度分布
长度分布
方向分布
曲率分布
扭结角分布
键相关函数(BCF)
均方根端到端距离(MSED)
均方根中点位移(MSMD)
标度指数
峰度过高
2D订单参数
可以在本文中找到更多信息和数据处理示例:
Usov,I和Mezzenga,R。FiberApp:一个用于跟踪和分析聚合物,细丝,生物大分子和纤维物体