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浅层UNet神经元分割SUNS的MATLAB匹配滤波代码
资源介绍
matlab匹配滤波代码
太阳
浅层UNet神经元分割(SUNS)是一种自动算法,用于从两光子钙成像视频中分割活动神经元。
它使用时间过滤和增白方案提取与活动神经元相关的时间特征,并使用紧凑的浅层U-Net提取神经元的空间特征。
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系统要求
内存:如果原始视频采用uint16格式,则原始视频的文件大小约为6倍。
如果原始视频采用float32格式,则约为原始视频文件大小的3倍。
首选CUDA兼容的GPU。
在Windows或Linux上安装
安装
启动Anaconda提示符并按顺序键入以下命令(SUNS_python_root_path是将提供的文件下载到的目录,例如C:/Users/{username}/Documents/GitHub/Shallow-UNet-Neuron-Segmentation_SUNS
):
cd
SUNS_python_root_path
cd
installation
conda
env
create
-f
environment_suns.yml
-n
suns
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