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fast_precise_hippocampus_segmentation_cnn代码实现matlab图片叠加功能
资源介绍
matlab图片叠加的代码通过深度卷积神经网络集成和转移学习进行快速精确的海马分割
该存储库对应于以下出版物：
Ataloglou，D.，Dimou，A.，Zarpalas，D.，Daras，P.Neuroinform（2019）。
它提供了在MRI数据集上评估所提出的方法所必需的代码和经过训练的模型，该数据集是研究中使用的两个公共数据集，还是新的。
此处提供的代码和说明已使用Ubuntu
16，MATLAB
2015b，Torch7和CUDA
v9.0进行了测试。
预处理步骤1（大脑提取和不均匀性校正）：
此过程使用以下软件包：
脑提取工具（BET），可作为FMRIB库v6.0的一部分获得
N3软件包，可作为MINC
Toolkit
v1.9.16的一部分获得
MINC工具包中也提供了Nifti和MINC格式之间的转换工具
要安装FMRIB库，请按照中提供的说明进行操作。
要安装MINC工具包，请按照中提供的说明进行操作。
将您要分段的MRI文件放在MRI/目录中。
MICCAI测试集的前两个测试MRI作为测试样本包含在此存储库中。
然后，运行bash脚本preprocess_1.s