PulseqDiffusion: 在Matlab中集成C代码以实现脉冲扩散功能

Matlab集成的c代码 PulseqDiffusion：使用开源PyPulseq进行加权加权回波平面成像序列 扩散加权成像（DWI）是许多临床应用（如中风和肿瘤表征）的重要序列。 尽管有几种与供应商无关的后处理工具可用于分发，但出于研究目的，尚未提供开放源代码收购实施。 我们提出了一个工具的开发PulseqDiffusion跨厂商，多切片单次激发自旋回波回波平面成像（EPI），使用基于扩散脉冲序列的开源包PyPulseq - ，其可以扩展到支持多b值和方向。 我们在（i）体外幻象上证明了这一点，以测量表观扩散系数（ii）在体内人脑数据中获得高质量的分数各向异性（FA）和平均扩散率（MD）图。 我们提供了在Matlab中实现的基本重构软件，用于从原始k空间数据生成图像。 在文件夹Example_Data提供了在哥伦比亚大学获得的示例数据（虚拟数据：3个方向，5个b值，3个切片； Vivo数据：12个方向，1个b值，20个切片和3个方向，3个b -values，20片）。 然后可以使用免费的后处理工具对图像进行处理，以生成定量扩散图。 该软件包中包含使用图像分析软件的示例代码。 一种预测